晉江市醫院（上海市第六人民醫院福建醫院）骨科是醫院最早開設的科室之一，1984年開設了骨科病房，擁有10張病床。骨科也是醫院最早利用對外合作資源創新發展的科室之一，1991年、1995分別與第三軍醫大學、福建醫科大學附屬第一醫院合作，開啟了以骨科專家派駐指導、專家效應帶動學科發展的新模式。2002年醫院病房大樓的建設投用后，骨科擁有了獨立病區，補齊硬件短板，為骨科的發展的鋪開了康莊大道。20年來，在“晉江經驗”的指引和推動下，骨科快速發展，2003年成立手足外科，2009年擴建成兩個病區，成為醫院最大的臨床科室。2020年骨科迎來了上海市第六人民醫院的青睞和幫扶。隨著2021年新院建成后的醫院整體搬遷，骨科更是進入了蓬勃發展的新時代，成為以骨科為特色的國家創傷區域醫療中心建設的核心發展科室。2021年新院搬遷后，骨科再一次擴建，編制床位291張，現已開設5個病區，開放182張床位，擁有十萬級層流潔凈肢體重建監護室、骨科特需病房。科室2022年入選“福建省級臨床重點專科建設項目”，2023年獲批的“福建省創傷骨科修復重建臨床醫學研究中心”。 在學術科研上，獲批福建省衛健委中青年重大課題（資金300萬）1項，省、市級課題項目10余項，獲批專利21項，近3年發表數篇論文，其中SCI源10余篇，科技核心10余篇，省級等各期刊若干。

科室現有醫生46人，其中主任醫師4名、副主任醫師11名，醫學博士4人，醫學碩士27人。醫生按脊柱、關節、創傷、運動醫學、修復重建等亞專業分組培養。科室年門診量超80000人次；年住院人次超7000人次；年手術量近6000人次，其中三/四級手術超80%。